Dengan janji untuk mengabulkan keinginan apapun, Holy Grail yang dahsyat memicu tiga perang di masa lalu, masing-masing terlalu kejam dan ganas untuk meninggalkan seorang pemenang. Terlepas dari itu, keluarga Einzbern yang kaya yakin bahwa Perang Holy Grail Keempat akan berbeda; yaitu, dengan sebuah kapal Holy Grail sekarang di genggaman mereka. Hanya karena alasan ini, “Pembunuh Magus” yang sangat dibenci Kiritsugu Emiya dipekerjakan oleh Einzberns, dengan menikah dengan putri satu-satunya Irisviel sebagai kontrak yang mengikat.
Kiritsugu sekarang berdiri di tengah-tengah permainan bertahan hidup yang keras, menghadapi enam peserta lain, masing-masing dipersenjatai dengan familiar kuno, dan didorong oleh keinginan dan cita-cita yang unik. Ditemani oleh familiarnya sendiri, Saber, tentara bayaran yang terkenal segera menemukan lawan terbesarnya di Kirei Kotomine, seorang imam yang mencari keselamatan dari kekosongan dalam dirinya dalam mengejar Kiritsugu.
Berdasarkan new ringan yang ditulis oleh Gen Urobuchi, Fate / Zero menggambarkan peristiwa Perang Holy Grail Keempat — x tahun sebelum Fate / remain nighttime. Saksikan royale pertempuran di mana tidak ada yang dijamin selamat.